ساواک برای تضعیف و خنثی کردن فعالیت‌های انقلابی روحانیان، راه چاره را در تبعید آنها به شهرهای حاشیه‌‌ای، کوچک و کم‌‌برخوردار دانست، اما این راهکار با شیوه‌ای که این روحانیان در پیش گرفتند به ضدخود تبدیل شد

نام آیت‌الله گلپایگانی، که مبارزات خود با رژیم پهلوی را از اوایل دهه 1340 آغاز کرده بود، پس از حادثه‌ای که برای فرزندش رخ داد، بیش از پیش به عنوان یک روحانی و عالم مبارز بر سر زبان‌ها افتاد؛ به‌گونه‌ای که حتی عوامل سفارت آمریکا نیز فعالیت‌های ایشان را زیر نظر گرفته بودند

وسعت اطلاعات این مرجع عالی‌قدر از منابع حدیثی، فقهی، رجالی و تاریخ اهل سنّت، در کنار اشراف کاملشان بر منابع شیعی، به ایشان چنان قدرتی داده بود که می‌توانستند تشابهات و تفاوت‌های بین مذاهب را تحلیل کنند و اندیشه تقریب مذاهب را تا جایی که اصول و مبانی آن مذاهب اجازه می‌دهد، پیش برند

در سال 1300ش، هنگامی‌که آیت‌الله حائری در مسیر سفر خود به مشهد، راهی قم شد، به اصرار علما و فضلای این شهر به‌ویژه آیت‌الله محمدتقی باقی یزدی در قم ماندگار شد و این ماندگاری باعث شد قم بسیار متفاوت از آن چیزی شود که پیش از آن بود

با طرح و اجرای قانون کشف حجاب، علما و روحانیان اولین گروهی بودند که عکس‌العمل شدیدی نسبت به این قضایا نشان دادند. در این بین، مخالفت آیت‌الله حائری از اهمیت خاصی برخوردار بود. او در حالی با قانون کشف حجاب مخالفت کرد که پیش از آن به واسطه برخی دلایل کمتر با حکومت رویارو شده بود